Diamond软件使用教程(二): 画氢键与定向生长

Crystal Impact Diamond是非常强大的分子和晶体结构可视化软件，能够获得非常多的关于结构的图文表述，使得复杂结构趋于简易可视化！

上一篇内容，为大家搜集整理了一些关于Diomand基础操作的内容，今天继续为大家整理了网上的教程资料，如何利用Diamond进行氢键的绘制与定向增长。

Diamond进行氢键的绘制

利用钻石软件进行氢键绘制，网络上的教程有特别多，相对比较简单，但是有一些事项需要注意！

基本的操作流程就是打开一个分子结构的CIF文件 — Build — Create H-Bonds — 参数设置 — 选择H键供体与受体 — 结束

操作流程示意图如下

补充说明：对氢键的作用距离和键角进行设置时，一般情况下，对于常规的氢键选用参数为 距离 1.2-1.8 , 键角 120-180，如果是对于C-H---X氢键，则需要查阅文献，寻找准确参数！

选择构成氢键的供体和受体

Diamond定向生长教程

定向生长教程，主要以图片为主，直接观察图片的箭头，足以学会！

选则定向生长的起始位置

固定范围，此处的值自己可以尝试反复修改，观察后续影响

键连目标原子

同样的操作进行设定

多次生长后的效果

如果固定的范围较大，如范围值调成10，效果如下

参数可以反复修改，进行定向生长，观察最终的结果进行对比，如果不是针对某一固定的位置，可以利用Diamond中的选项，选择部分或者全部的对象，在一定范围进行生长，如果为了凸显出，材料中的特殊结构，则可以选择利用上述的方法，进行操作！